一、概念不同。
有機食品通常來自于生態(tài)良好的有機農(nóng)業(yè)生產(chǎn)體系，根據(jù)國際有機農(nóng)業(yè)生產(chǎn)要求和相應(yīng)的標準生產(chǎn)加工的。
綠色食品是指按特定生產(chǎn)方式生產(chǎn)，并經(jīng)國家有關(guān)的專門機構(gòu)認定，允許使用綠色食品標志的無污染、無公害、安全、優(yōu)質(zhì)、營養(yǎng)型的食品。
從概念上看，有機食品和綠色食品均屬于無污染、可安全食用的食品，但有機食品更加強調(diào)食品的天然性，提倡用自然、生態(tài)平衡的方法從事生產(chǎn)的食品。綠色食品則強調(diào)食品沒有污染，無公害可放心食用。
二、標準不同。
不同的國家、不同的認證機構(gòu)，其標準也不相同。
我國的有機食品標準是由國家環(huán)境保護總局有機食品發(fā)展中心制定的認證標準，該標準較好地規(guī)范和管理了包括有機認證機構(gòu)及有機生產(chǎn)、加工和貿(mào)易者在內(nèi)的中國有機食品行業(yè)，使之健康有序地向前發(fā)展。
我國的綠色食品標準是由中國綠色食品中心組織指定的統(tǒng)一標準，該標準以“從土地到餐桌”全程質(zhì)量控制理念為核心，由以下四個部分構(gòu)成：(1) 綠色食品產(chǎn)地環(huán)境標準；(2) 綠色食品生產(chǎn)技術(shù)標準；(3) 綠色食品產(chǎn)品標準；(4) 綠色食品包裝、貯藏運輸標準。
三、標志不同。
有機食品標志在不同國家和不同認證機構(gòu)是不同的。2001年國際有機農(nóng)業(yè)運動聯(lián)合會(IFOAM)的成員擁有有機食品標志380多個，我國國家環(huán)境保護總局有機食品發(fā)展中心在國家工商局注冊了有機食品標志。
綠色食品標志在我國是由中國綠色食品發(fā)展中心制定，并在國家工商局注冊的質(zhì)量認證商標，是統(tǒng)一也是唯一的，屬知識產(chǎn)權(quán)范疇，受《中華人民共和國商標法》保護。中國綠色食品的標志由三部分構(gòu)成：上方的太陽、下方的葉片和中間的蓓蕾，象征自然生態(tài)。標志圖形為正圓形，意為保護、安全。顏色為綠色，象征著生命、農(nóng)業(yè)、環(huán)保。
四、認證機構(gòu)不同。
我國有機食品的認證由國家認監(jiān)委批準、認可的認證機構(gòu)進行。有機食品標志認證一次有效許可期限為一年，一年期滿后可申請“保持認證”，通過檢查、審核合格后方可繼續(xù)使用有機食品標志。
我國綠色食品的認證機構(gòu)僅有中國綠色食品發(fā)展中心一家，該中心負責全國綠色食品的統(tǒng)一認證和最終審批。
雖然有機食品和綠色食品有不同的概念、標準和認證機構(gòu)，但安全是它們的共性，它們從種植、收獲、加工生產(chǎn)、貯存及運輸過程中都采用了無污染的工藝技術(shù)，保證了食品的安全性。
